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自然保护就是对自然环境和自然资源的保护。自然环境是指自然界中的土壤、矿藏、气候、地质和生物等。自然资源就是指土地资源、水利资源、森林资源、动植物资源和以山水名胜、自然风光为主的旅游资源等。自然保护区就是为了保护自然资源、濒于灭绝的生物物种、自然历史的遗产等，而人为划定的、进行保护和管理的特殊区域。
自然保护区要对尚未开拓的，具有典型代表性的自然综合体进行保护。自然保护区按其保护的对象可分为动植物综合性保护区和专业性保护区两大类。综合性保护区是对整体生态系统进行全面保护，例如：我国长白山、太白山等自然保护区。在这些保护区内，既保护具有特色的动植物，也保护土壤、水源、植被、岩洞等自然景观；专业性保护区是以一些特定的动植物群落（如热带雨林等）、物种（大熊猫、水杉）、地区（鸟岛、蛇岛）、水域（水禽繁殖地及越冬地）等为保护对象，特别是对珍稀生物和濒危动物的保护。例如：我国的大熊猫、东北虎、金丝猴等动物；植物方面有银杉、珙桐等。
我国北京延庆县的松山自然保护区，占地６６６７公顷，主要保护对象是森林植被和野生动植物种。浙江省临安县西天目自然保护区，主要保护珍稀树种柳杉、金钱松、根杏等及一些珍贵野生动物。安徽省广德县扬子鳄自然保护区，主要保护珍稀爬行动物扬子鳄及其栖息的环境。
建立自然保护区对于保护森林生态系统、保护濒于灭绝的珍稀野生动物、改善自然环境、维护生态平衡和促进科学研究，都发挥着重要作用。
1、就地保护
为了保护生物多样性，把包含保护对象在内的一定面积的陆地或水体划分出来，进行保护和管理。
比如，建立自然保护区实行就地保护。自然保护区是有代表性的自然系统、珍稀濒危野生动植物种的天然分布区，包括自然遗迹、陆地、陆地水体、海域等不同类型的生态系统。自然保护区还具备科学研究、科普宣传、生态旅游的重要功能。
2、迁地保护
迁地保护是在生物多样性分布的异地，通过建立动物园、植物园、树木园、野生动物园、种子库、基因库、水族馆等不同形式的保护设施，对那些比较珍贵的物种、具有观赏价值的物种或其基因实施由人工辅助的保护。
迁地保护目的只是使即将灭绝的物种找到一个暂时生存的空间，待其元气得到恢复、具备自然生存能力的时候，还是要让被保护者重新回到生态系统中。
3、建立基因库
人们已经开始建立基因库，来实现保存物种的愿望。比如，为了保护作物的栽培种及其会灭绝的野生亲缘种，建立全球性的基因库网。大多数基因库贮藏着谷类、薯类和豆类等主要农作物的种子。
4、构建法律体系
人们还必须运用法律手段，完善相关法律制度，来保护生物多样性。比如，加强对外来物种引入的评估和审批，实现统一监督管理。建立基金制度，保证国家专门拨款，争取个人、社会和国际组织的捐款和援助，为实践工作的开展提供强有力的经济支持等。
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